Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgf29Q9DA08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgf29Q9DA08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms