Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Speer4f1Q9D5Q6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4f1Q9D5Q6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms