Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7Q9D541 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc7Q9D541 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7Q9D541 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms