Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D4W2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms