Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Krtap5-3Q9D226 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krtap5-3Q9D226 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krtap5-3Q9D226 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms