Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc77Q9CZH8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc77Q9CZH8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms