Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prelid3bQ9CYY7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prelid3bQ9CYY7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms