Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmd8Q9CX56 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmd8Q9CX56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmd8Q9CX56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms