Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Utp23Q9CX11 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp23Q9CX11 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp23Q9CX11 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms