Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930553M12RikQ9CUH1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930553M12RikQ9CUH1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms