Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufb9Q9CQJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms