Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nudt21Q9CQF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nudt21Q9CQF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms