Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl17Q9CPR4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl17Q9CPR4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl17Q9CPR4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms