Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe41Q99PV5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe41Q99PV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms