Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GpnmbQ99P91 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms