Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NsmfQ99NF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms