Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Acss1Q99NB1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acss1Q99NB1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acss1Q99NB1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms