Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cstf3Q99LI7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cstf3Q99LI7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms