Protein–RNA interactions for Protein: Q99L90

Mcrs1, Microspherule protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrs1Q99L90 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mcrs1Q99L90 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mcrs1Q99L90 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms