Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lactb2Q99KR3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lactb2Q99KR3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms