Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NifkQ91VE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NifkQ91VE6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms