Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef3Q8VCC8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef3Q8VCC8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef3Q8VCC8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
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