Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg10Q8R1P4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg10Q8R1P4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg10Q8R1P4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms