Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OptnQ8K3K8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OptnQ8K3K8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms