Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ndufs8Q8K3J1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ndufs8Q8K3J1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ndufs8Q8K3J1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ndufs8Q8K3J1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ndufs8Q8K3J1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ndufs8Q8K3J1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ndufs8Q8K3J1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ndufs8Q8K3J1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ndufs8Q8K3J1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ndufs8Q8K3J1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms