Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prpf39Q8K2Z2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms