Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf628Q8CJ78 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Znf628Q8CJ78 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Znf628Q8CJ78 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf628Q8CJ78 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms