Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upp2Q8CGR7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upp2Q8CGR7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms