Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGB3

Uaca, Uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats, mousemouse

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UacaQ8CGB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UacaQ8CGB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UacaQ8CGB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UacaQ8CGB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms