Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hpf1Q8CFE2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Hpf1Q8CFE2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Hpf1Q8CFE2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Hpf1Q8CFE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hpf1Q8CFE2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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