Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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Trerf1Q8BXJ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trerf1Q8BXJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Trerf1Q8BXJ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Trerf1Q8BXJ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trerf1Q8BXJ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trerf1Q8BXJ2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trerf1Q8BXJ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trerf1Q8BXJ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trerf1Q8BXJ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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