Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slx1bQ8BX32 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slx1bQ8BX32 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms