Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scfd2Q8BTY8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scfd2Q8BTY8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms