Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep55Q8BT07 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cep55Q8BT07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep55Q8BT07 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.8 ms