Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tspan12Q8BKT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms