Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39bQ810L4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem39bQ810L4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem39bQ810L4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms