Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll4Q80UG8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll4Q80UG8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms