Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc93Q7TQK5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc93Q7TQK5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms