Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Actn1Q7TPR4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Actn1Q7TPR4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms