Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp397Q7TNK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp397Q7TNK4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp397Q7TNK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms