Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sbno2Q7TNB8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sbno2Q7TNB8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbno2Q7TNB8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms