Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shq1Q7TMX5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shq1Q7TMX5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Shq1Q7TMX5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
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