Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd3Q6ZQK0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd3Q6ZQK0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms