Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp34Q6ZQ93 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp34Q6ZQ93 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp34Q6ZQ93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms