Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd300lfQ6SJQ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd300lfQ6SJQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms