Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim45Q6PFY8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim45Q6PFY8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms