Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rad54bQ6PFE3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad54bQ6PFE3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms