Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gramd2bQ6PEM6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gramd2bQ6PEM6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gramd2bQ6PEM6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gramd2bQ6PEM6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gramd2bQ6PEM6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms