Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc36Q6PDM4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc36Q6PDM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms