Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam222bQ6P539 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam222bQ6P539 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms